1922年4月26日，中共在广州召集干部会议，议题之一是讨论国共关系，因为4月4日在杭州召开的中共中央全会上，马林建议共产党人加入国民党，未被接受。4月6日，陈独秀写信给共产国际远东局代表维经斯基，反对马林关于全体共产党员和青年团员加入国民党的建议，所列举的六条理由包括：国共两党宗旨及基础不同；国民党联美国，联张作霖、段祺瑞等政策和共产主义太不相容；国民党未发表党纲，在人民看来，仍是争权夺利的政党；广东实力派陈炯明反对孙中山派甚烈，加入国民党将立即受其敌视，在广东不能活动；孙中山派向来对于新加入分子，绝对不能容纳其意见及假以权柄；中共各区均已开会反对等。[52]
陈独秀的看法与中共广东支部成员的意见相当吻合，在广州干部会议上，林伯渠支持孙中山，谭平山、陈公博、谭植棠等多数人则批评孙而支持陈炯明，认为孙、陈不和是由于陈受到孙左右的排挤，赞扬陈同情社会主义，曾以省政府名义竭力支持香港海员罢工等。主持会议的陈独秀左右为难，做结论时主张与国民党所有革命分子合作，避免卷入其内部斗争。[53]尽管其间少共国际代表达林再次建议组织加入国民党，中共同意党外合作，结成统一战线，但反对加入国民党。5月，陈独秀在陈公博、陈秋霖、黄居素等人陪同下，前往惠州与陈炯明会晤。他看出孙、陈之间难免爆发大冲突，应知有所适从，论道理是应当联孙，论力量是应当联陈[54]，依然难以取舍。